恐竜の歯＋α

ナノティランヌス関係、新たなニュース

Figure;
T-rex premaxillary tooth
Hell Creek Formation
Garfield Co. Montana, USA.



写真は直接関係ないのですが、この写真の標本の提供元であるck preparationsが大いに関わっているニュースです。

ck preparationsという自前発掘系の標本業者が宣伝していた「ティランノサウルス類の新しい全身骨格」についてです。前々から同社のサイトで宣伝はされていましたが、まだ論文になっていない、科学的な意味では公になっていない骨格です。いろいろスゴイのですが、実はケラトプス類の骨格と一緒に見つかっていて、いわゆる格闘化石らしいのです。しかもケラトプス類は新種であり、一方のティランノサウルス類は今回「ナノティランヌス」だろうと明言されました。

今回驚いたのは、このプロジェクトにブラックヒルズ地質学研究所がつるんでいたということです。新しいウェブサイトのほうは、ブラックヒルズ地質学研究所がホストのようです。

そして、トップページにもある通り、研究機関向けにこの骨格を売りに出すようです。論文が出るのはまだまだ先かと思われますが、楽しみですね。

気が向いたら現時点でのピーター・ラーソン氏の見解を日本語でブログにまとめておこうとおもいます。

詳しくは下記リンクからどうぞ。　http://www.duelingdinos.com/

[ひろさん]

ご無沙汰しております。これはまた興味深いニュースですね。＾＾ナノティラヌスと新種のカスモサウリナエですか？この時代だとトリケラトプスかトロ・・・がまず、当たり前なのですが第三の角竜とは、今後の研究がたのしみですね。

[DONGO]

最近ＣＫＰの新商品が出ないと思っていたらこんなすごい事をしていたんですね。ナノとされる獣脚類の頭骨はしっかり保存されていそうなので、ナノの歯形態の解析も進むと良いですね。論文が待ち遠しいです＾＾

[catappledog]

ひろさん、こちらこそご無沙汰しております。いろいろ楽しみな標本です。スゴイ標本なのですが、ちいさな発掘業者のページでしかこれまで告知されていなかったのであんまり有名ではありませんでした。。。 BHIが関与したことで一気にメジャーになると良いのですが

[catappledog]

DONGOさん、ほんと、なかなか更新されませんよね。値段はもとにもどったのに、まだ「半額セール中」って書いてあるし・・・^^i ckpが「ナノの歯とjuvenile-T rexの歯には違いがある」って主張しているひとつの根拠なのかもしれません。記載論文を書く研究者の方には、骨格だけでなく歯も詳しく解析して頂きたいですね

リンク先を見ましたが、相当な保存程度ですね。どのような状況で土砂に埋没したのでしょうか。
CK某はそんなすごい業者なんですか。なんで入手したのかは失念しましたが、私のブログのトップページのは歯は、確かCK某のものだったような…。

[catappledog]

chosukeさん、すごい標本です。どうして埋ってしまったんでしょうね^^i ck某は個人的にはすごくお世話になっている会社です。。。運がいいとあり得ないくらい安価で標本が手に入りますし。ドラコレクスの頭蓋骨をクリーニングしてレプリカを作っていますし、渋い路線で攻めてくる会社ですね。

恐竜の歯 TOP PAGE

 

日本最大級の恐竜の歯専門ブログへようこそ。

このブログは、日本で恐竜化石発見を目指す採集家の方々を応援しています。

一本一本の歯化石を大切に、詳細に分析していきます。

「集めて並べて自慢するだけ」になりがちな「普通のコレクター」からの脱却を目指します。

未公開標本多数！

更新が追い付いておりませんが、

鋭意解析中です。

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■当ブログはこれまで、モロッコ産の小型獣脚類の歯化石が「アベリサウルス類」のものであることをいち早く指摘してきました。このタイプの歯は、いまでもなお「デルタドロメウスの歯」「バハリアサウルスの歯」「ラプトルの歯」「ドロマエオサウルス類の歯」などと誤ったラベルを付与されて流通しています（図左：アベリサウルス類の代表格マジュンガサウルス。図右：モロッコ Kem Kem Bedより産出したアベリサウルス類の歯）。この歯の持ち主は、Mahler (2005)が記載したアベリサウルス類である可能性があります。

 

 

■混同されがちなパキケファロサウルス類とテスケロサウルスの歯牙形態の差異を検討しており、ようやく核心に近づきつつあります。リッジの強さはテスケロサウルスの方が強い傾向にあります（図左：テスケロサウルスの歯。多数の明瞭な溝が認められます。また、セントラルリッジが発達します。図右：パキケファロサウルス類の歯。ドラコレックスの記載論文で示された上顎骨歯に酷似しています）

 

 

■獣脚類の歯の形状が対数関数で近似的に表現できることを発見しました。歯の先端部が欠損した標本であっても、対数関数近似を外挿することで、歯の大きさなどを推定することができます（図左：T-rexの右第13歯骨歯もしくはその近辺の歯。先端が欠けていますが、対数関数近似によって大まかな歯尖apexの位置を見積もることができます。これによって解析に必要な形態学的パラメータが推定可能です。図右は同じ歯の生画像）。

 

 

■アマチュアとしては いち早くSmith (2005) の研究成果を取り入れ、獣脚類の歯の線形判別分析を開始しました。誤同定されていたモンゴル産トロオドン類の歯化石に判別分析を適用し、サウロルニトイデスである可能性を示唆しました。左図：モンゴル産トロオドン類の歯、右図：判別分析でサウロルニトイデスのクラスター近くにプロットされた様子。

 

 

■また、フィールドワークでは、(新発見ではありませんが）一般にはあまり知られていなかった「カーステニセラス」という下部白亜系のアンモナイトをご紹介してきました。これは、特に長野県佐久穂町の石堂層で多く見出される種です。化石採集・鉱物採集とも、活発に行ってきました。左図：カーステニセラス（長野県石堂層、1995年採集）、右図：高温熱水脈鉱床から産した緑柱石（茨城県、2006年採集）。

 

 

 

このように、恐竜の歯を中心として、化石・鉱物に関するさまざまな情報を発信しております。今後とも、日本最大級の恐竜歯化石専門ブログとしてコンテンツを拡充していきます。採集家の方、コレクターの方、心より歓迎申し上げます。日本で新たな恐竜化石を発見しましょう！

恐竜の歯：これは何？

Bone Cabine Quarry, Wyoming, USA
Late Jurassic, Morrison Formation
Height = 2.5 mm


Answer a quiz!

This is a very small tooth from Morrison formation.
Which dinosaur did have this tiny tooth?
Not only its shape, but also its size is essential.

This is very important probrem to understand identity
of the tooth I uploaded previously in my blog.
-> http://blogs.yahoo.co.jp/catappledog22/43645312.html


クイズです。

モリソン層（ジュラ紀後期）から採集された非常に
小さな歯化石です。2.5ｍｍしかありません。
この大きさが重要です。

こっちの過去記事の歯が何なのか、というのを考える上でも
大事な問題だと思います。
-> http://blogs.yahoo.co.jp/catappledog22/43645312.html

[化隕鉱宝]

Catappledog様、この大きさならオスニエロサウルス(旧名オスニエリア）でしょうか、イグノアドン科にしては小さいと思いますので。

[catappledog]

化隕鉱宝さま、さっそく正解です。"Othnielia rex"として供給された標本です。これとよく似たDrinker nistiという恐竜も見つかっていますので歯だけで両者を分けることはなかなか難しいです。で、その「Drinker nistiの歯」とされる化石を12月のショーでGさんから買ったのですが、全く文献の図と違う形・大きさで、もちろん今回の歯とも全然違う形なのです。例によって間違えなのだと思っていますが、正体が未だにわかりません^^i

[DONGO]

いわゆる「木の葉型の歯」ですよね。ヘルクリーク産のものとは違った趣といいますか、面白さがありますね。
Basal ornithopodの歯なのだろうなーと思いますが、難しいです。
モリソン木の葉も勉強したいと思います＾＾

[catappledog]

DONGOさん、状態は悪いのですが、木の葉型の形態が辛うじて残った標本です。この系統の歯を探しているのですが、なかなか手に入りません。。。文献の図を見ると、Othnielia(Othnielosaurus)やDrinkerって歯の大きさが2mmくらいしかないんですよね。私は持っていませんが、昔Gさんが売っていたOthnieliaは結構大きい歯冠だったように記憶していますので、あれもまた別物なのでしょうね。OthnieliaとDrikerの歯は区別できるという話もあるようですが、本当かどうかはワカリマセン。

恐竜の歯：アジア産トロオドン類Ｃ

Troodontid gen. et sp. indet.　CH=5.0mm
Late Cretaceous, Djadochta Formation. Bayn Dzak, Mongolia

This is the third Troodontid tooth from Mongolia.
You can see very large denticles on the distal carina.
The tooth was also identified with Byronosaurus tooth.
Of course this was completely wrong because Byronosaurus
doesn't have such large serration.
I will analyse the tooth by linear discriminant analysis
and show you the result in the next article.

３つめのトロオドン類の歯です。

[化隕鉱宝]

Catappledog様、この歯はまさにトロオドン型のパニコロドン歯ですね。これがモンゴル産ではなく北米産だと言われても判らないと思います。ティランノサウルス科の起源はアジアだと言われていますが、ドロマエオサウルスなどの小型獣脚類の方がより似ているように思います。

[DONGO]

以前の二つとも違った雰囲気の歯ですね。
細長い鋸歯がなんとも特徴的ですね、解析楽しみにしています＾＾

[catappledog]

化隕鉱宝さま、詳細写真はまた後ほどupいたしますが、実はパロニコドンと言えるほど表面のリッジは存在しません。このような小型獣脚類も、北米とアジアとあまねく存在していたんでしょうね^^

[catappledog]

非常に特徴的で、近親側にまったく鋸歯がありません。そういった意味では、北米の「ぺクティノドン」的ですが、やや大きいです。北米のトロオドン属とは全然違う形態ですし、トロオドン類がいかに多様な存在だったのかがわかりますね。

恐竜の歯：CA2とDAVG2の計算法

■Figure.1 Distal serrations of Saurornitholestes tooth. DAVG is average distal serration
densities. Then, What is the DAVG2 ??

Today I will show you how to calculate CA2 and DAVG2. Both CA (Crown Angle) and
DAVG(AVeraGe Distal serration densities) are important variables for describing
morphological characters of theropod dinosaur teeth. CA2 and DAVG2 are gotten
from CA and DAVG respectively using some statistical calculations.
As mentioned by Smith et al. (2005), CA and DAVG are not size metrics but which
are affected by tooth size. They employed principal component analysis (PCA) to
correct the effect of tooth size.

Here, I explain the process of CA2 and DAVG2 calculation using R and Microsoft Excel.
The R software is avalable from this URL; http://www.r-project.org/

Step 1. Preparation for analysis

First, you should download and install R. → http://www.r-project.org/
You are also needed to install psych pakage to R before step 3.
For japanese user, this URL is helpful for installation.
→http://cse.niaes.affrc.go.jp/miwa/ja/R/setupReasy/index.html
Second, copy the data of Smith et al.(2005) to spreadsheet such as Excel.
Nine variables below must be included in spreadsheet table;
TAXON, CBL, CBW, CH, AL, CBR, CHR, CA, DAVG.

Step 2. Log-transformation of variables

Calculate common logarithm of all metrics other than TAXON. In Microsoft Excel,
this transformation can be carried out by LOG10() function.
You may also use R or other software such as MATLAB for this transformation.

Step 3. PCA with psych package

Start the R software. In the spreadsheet, copy all the log-transformed data
to clipboad. And then return to R console, type next command.

data<-read.delim("clipboard")

Now the theropod data set is imported to R, you can run PCA calculations.
After importing psych pakage, run principa() command. Select "varimax" in rotate option.

library(psych)
fit<-principal(dat,nfactors=2,rotate="varimax",scores=TRUE)

Immediately, you will get the result of PCA. To get the principal component scores, type

fit$scores

We use these principal component scores for next step.

Step 4. Regression analysis

Copy the 1st principal component scores (PCS1) to the spreadsheet.
Generate scatter plot of PCS1 vs. CA, or PCS1 vs. DAVG, and calculate
linear regression line. You can use Chart Wizard of Excel for both making
chart and regression analysis.This process is also can be done by use of R.
Please use whichever you like best.

Step 5. Calculation of residuals

After determine the formula of the regression lines, calculate residuals (ε)
for each data. A1, A2, B1 and B2 are constant value from regression analysis.

log(CA) = A1・PCS1 + B1 +ε1
log(DAVG) = A2・PSC1 + B2 +ε2

* log(x) is common logarithm here.

Here, ε1 is called CA1, and ε2 is called DAVG2 by Smith et al. (2005).
We can use these parameters for discriminant analysis of theropod teeth.
Note that we need all the data for calculation of each CA2 and DAVG2.

というわけです。SmithのデータをぜんぶExcelにコピーして、TAXON, CBL, CBW, CH,
AL, CBR, CHR, CA, DAVG以外を削除しておきます。この値を全てLOG10()関数で
常用対数に変換し、そのデータを一括で統計ソフトRに読み込みます。
対数変換はLOG10()を使ってもいいですし、Visual BasicでもMATLABでもRでも何でも
できますので、お好みのツールで変換します。
Rのpyshパッケージ（フリーでインストール可能です）を使い、主成分分析(PCA)を
行います。オプションでrotate="varimax"とすることで、バリマックス回転をかけます。
＊今回の例は、コマンドはバリマックス回転になっていますが、グラフはrotate=TRUEで
計算したものになっていますのでご注意ください。

＊主成分分析(PCA)についてはこちらを参照
http://en.wikipedia.org/wiki/Principal_component_analysis
＊数式なし、日本語のページだと
http://home.a02.itscom.net/coffee/tako04.html
だが、数式を封印しているせいでかえって分かりにくいかもしれません。
＊バリマックス回転については
http://en.wikipedia.org/wiki/Varimax_rotation
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/Yogoshu/17.html

第一主成分得点とlog(CA), 第一主成分とlog(DAVG)で回帰分析を行った残差が、それぞれCA2,
DAVG2です。ポイントは、すべてのデータセットがないと、CA2とDAVG2は計算できない
ということです。データセットが変われば、値が変わります。

Smith(2005)のように、CA2やDAVG2を使って判別関数を構成することもできますので、
次回以降、提示していきたいと思います。

[化隕鉱宝]

catappledog様、今回は一段と専門的な内容ですね。基礎知識がないとグラフを読み取ることは出来ないのでしょうか。

[catappledog]

化隕鉱宝さま、古生物学の問題と言うより数学や統計学の問題になってしまうので、少しそちらの知識がいるかもしれません。ただ、ここでやっている計算はあくまでも歯冠角(CA)と遠心側平均鋸歯密度(DAVG)から、歯のサイズの影響を取り除くための操作です。グラフは、これ自身から何かを読み取るというより、回帰直線と各々の点の差から新しい尺度を作り出すためのものです。Smithら(2005)は、この新しい尺度を使って判別分析をやる方がよりと主張しているわけです。

[DONGO]

CA2やDAVG2はちんぷんかんぷんだったのですが、おぼろげながら分ってきました＾＾；
話は変わりますが、写真のサウロルニトレステスの鋸歯は状態良いですね〜＾＾、顕微鏡で撮影したんですね！

[catappledog]

DONGOさん、わざわざCA2やDAVG2を計算するあたり、Smithらもかなり苦労して解析していたんだろうなーと想像します。が、CA2やDAVG2を使ってもSmithらの判別率より低くなってしまうんです。何かもう一つ細工があるのかな、と思っています。。。サウロルニトレステスは実体顕微鏡で撮りました。デジカメ接続できるらしいのですが、よくわからずに接眼レンズごしに撮影です(^^i