| 2015年度作業内容 |
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| ①肝移植データベースシステム移行支援（中澤先生、福田 晃也先生） |
| ・筑波大学CREILデータセンター担当者とのやりとり |
| ・筑波大から受領したプログラム一式、データファイルの内容詳細確認 |
| ・プロジェクト担当者や情報管理室との打ち合わせ |
| ・サーバ移行方針決定のための調査と提案 |
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| ②羊膜遺伝子発現解析（豊田先生、森下先生） |
| ・各種サンプル、遺伝子セットの組み合わせでクラスタリング、各種統計解析 |
| ・各種組み合わせでサンプル間差分解析（様々な組み合わせで） |
| ・各種サンプル、遺伝子セットの組み合わせでGO解析、パスウェイ解析、ベン図解析 |
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| ③NCBI GEOデータ登録・更新 |
| ・NEDO Agilent Arrayデータ登録調査（梅澤先生） |
| ・羊膜 Agilent Arrayデータ登録（豊田先生） |
| ・iPSC 450K Methylation Arrayデータ登録（西野先生） |
| ・Sclera Agilent Arrayデータ登録（世古先生） |
| ・iPSC 450K Methylation Arrayデータ公開時期通知と変更（西野先生） |
| ・Sclera Agilent Arrayデータ公開時期通知と変更（世古先生） |
| ・SEES SNP Arrayデータ公開時期通知と変更（梅澤先生、岡村先生） |
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| ④NCBI SRAデータ登録・更新 |
| ・ XP40OS Whole Exome Seq 登録（岡村先生） |
| ・ Embryo transcriptome RNA-Seqデータセット①登録（福田先生） |
| ・ Embryo transcriptome RNA-Seqデータセット②登録（福田先生） |
| ・ Embryo transcriptome RNA-Seqデータセット③登録（福田先生） |
| ・ XP3OS and XP-EMB1サンプル情報の修正、NCBI担当者とのやりとり（岡村先生） |
| ・ XP40OS サンプル情報の修正、NCBI担当者とのやりとり（岡村先生） |
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| ⑤DDBJデータ登録・更新 |
| ・登録済みRNA-Seqデータセット公開作業、DDBJ担当者とのやりとり（福田先生） |
| ・海外研究者（ユーザ）からの問い合わせ対応（福田先生） |
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| ⑥健常日本人男性JOM005 loss/gainチェック（岡村先生） |
| ・日本人女性集団のloss/gainの位置との照合作業 |
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| ⑦WGS/EGSのCNV予測ツールの検討（岡村先生） |
| ・候補ツールの調査、絞り込み |
| ・インストール試み |
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| ⑧Exome解析アノテーションツールのバージョンアップ対応（岡村先生） |
| ・各種公共データベース最新版ダウンロード |
| ・Annovar最新版と現行版の差異調査 |
| ・Annovar最新版インストールに伴うプログラム改修 |
| ・ToMMo頻度データ追加へのプログラム改修 |
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| ⑨顕微鏡画像表示システム（梅澤先生） |
| ・パクさんシステムのAWS移行調査、東大医科研打ち合わせ |
| ・AWS上で稼働する顕微鏡画像システムの設計・開発 |
| ・顕微鏡画像ファイル前処理プログラム開発 |
| ・顕微鏡画像前処理、登録、公開作業（約890件） |
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| ⑩肝8サンプル遺伝子発現解析（梅澤先生） |
| ・クラスタリング、PCA |
| ・目的の遺伝子セットでのデータ抽出 |
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| ⑪Edom構造変異（岡村先生） |
| ・SNPアレイデータからKaryoStudio上で全染色体を目視確認 |
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| ⑫qPCRデータ解析（阿久津先生） |
| ・各種条件でデータ前処理 |
| ・各種クラスタリングアルゴリズムでクラスタリング |
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| ⑬Embryo transcriptome RNA-Seqデータ解析（福田先生） |
| ・データ前処理 |
| ・各種クラスタリングアルゴリズムでクラスタリング |
| ・目的の染色体上の遺伝子で解析 |
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| ⑭未分化・分化細胞の判別式作成（阿久津先生） |
| ・qPCRデータデータ前処理 |
| ・判別遺伝子の抽出 |
| ・最適判別式の絞り込み |
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| ⑮ | 強膜遺伝子発現データ再解析（世古先生） |
| ・データセットを入れ替えて解析 |
| ・目的の遺伝子セットで解析 |
| ・過去の結果との比較 |
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