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library(gcookbook)
library(MASS)
str(Animals)
p <- ggplot(Animals,aes(x=body,y=brain,label=rownames(Animals)))+geom_text(size=3)
p
windows()
p+scale_x_log10()+scale_y_log10()
10^(0:3)
10^(-1:5)
p+scale_x_log10(breaks=10^(-1:5))+scale_y_log10(breaks=10^(1:3))
library(scales)
p+scale_x_log10(breaks=10^(-1:5),labels=trans_format("log10",math_format(10^.x)))+
scale_y_log10(breaks=10^(0:3),labels=trans_format("log10",math_format(10^.x)))

p+scale_x_log10(breaks=10^(-1:5),labels=trans_format("log10",math_format(10^.x)))+
scale_y_log10(breaks=10^(0:3),labels=trans_format("log10",math_format(10^.x)))

windows()
p <- ggplot(Animals,aes(x=body,y=brain,label=rownames(Animals)))+geom_text(size=3)
p+annotation_logticks()+
scale_x_log10(breaks=10^(-1:5),labels=trans_format("log10",math_format(10^.x)))+
scale_y_log10(breaks=10^(0:3),labels=trans_format("log10",math_format(10^.x)))

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library(ggplot2)
library(gcookbook)
str(tophitters2001)
?tophitters2001
tophit <- tophitters2001[1:25,]
ggplot(tophit,aes(x=avg,y=name))+geom_point()
tophit[,c("name","lg","avg")]

ggplot(tophit,aes(x=avg,y=reorder(name,avg)))+
geom_point(size=3)+
theme_bw()+
theme(panel.grid.major.x=element_blank(),
panel.grid.minor.x=element_blank(),
panel.grid.major.y=element_line(colour="grey60",linetype="dashed"))


ggplot(tophit,aes(x=reorder(name,avg),y=avg))+
geom_point(size=3)+
theme_bw()+
theme(axis.text.x=element_text(angle=60,hjust=1),
panel.grid.major.y=element_blank(),
panel.grid.minor.y=element_blank(),
panel.grid.major.x=element_line(colour="grey60",linetype="dashed"))

nameorder <- tophit$name[order(tophit$lg,tophit$avg)]
nameorder
tophit$name <- factor(tophit$name,levels=nameorder)
tophit$name

ggplot(tophit,aes(x=avg,y=name))+
geom_segment(aes(yend=name),xend=0,colour="grey50")+
geom_point(size=3,aes(colour=lg))+
scale_colour_brewer(palette="Set1",limits=c("NL","AL"))+
theme_bw()+
theme(panel.grid.major.y=element_blank(),
legend.position=c(1,0.55),
legend.justification=c(1,0.5))

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 library(gcookbook)
str(marathon)
data(marathon, package="gcookbook")
sp<-ggplot(marathon,aes(x=Half,y=Full))+geom_point()
sp+coord_fixed()+
scale_y_continuous(breaks=seq(0,420,30))+
scale_x_continuous(breaks=seq(0,420,30))

sp+coord_fixed(ratio=1/2)+
scale_y_continuous(breaks=seq(0,420,30))+
scale_x_continuous(breaks=seq(0,420,15))


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